Per amministrare Portal for ArcGIS, è talvolta necessario avviare e arrestare il portale allo scopo di eseguire interventi di manutenzione o configurare impostazioni avanzate.
Portal for ArcGIS viene eseguito con l'account utilizzato per installare il software. Tale account viene definito account di Portal for ArcGIS. È necessario accedere al computer che ospita il portale con l'account proprietario dell'installazione e utilizzare gli script della riga di comando stopportal.sh e startportal.sh per arrestare o avviare il portale. Gli script si trovano nella cartella radice della directory di installazione di Portal for ArcGIS.