ArcGIS Server 允许您在文件夹中对服务进行组织。您可以基于地理区域、安全级别、Web 服务消息格式或其他条件创建文件夹。例如，您可以创建 Redlands 文件夹，并将与 Redlands 市相关的所有服务放入其中，也可以为高安全级别的服务创建文件夹，并为其配置限制较高的访问参数。
所有文件夹均保存在站点（根）文件夹中。在管理器中，您会看到根文件夹中包含所有其他文件夹。各服务也位于根文件夹级别。在 ArcCatalog 或 ArcGIS Desktop 的目录窗口中，根文件夹中包含 GIS 服务器名称下直接可见的所有服务和文件夹。Web 服务消息格式（即 SOAP 和 二进制）将设置在根文件夹级别。因此，更改其属性会影响根文件夹中所有其他文件夹。
与计算机上的文件系统不同，ArcGIS Server 上的文件夹只允许存在一级；因此，无法在文件夹中嵌套文件夹。如果您仅拥有几项服务，则可以将这些服务存放在服务器的根文件夹中，而不要额外创建文件夹。如果文件夹包含服务，则无法对其重命名。
可在任意文件夹级别设置 Web 服务安全性。要了解有关根据用户和角色限制文件夹访问的详细信息，请参阅控制 ArcGIS Server 中的访问。